Çocukluk çağında endoskopi hayatın ilk gününden itibaren güvenle yapılabilen bir işlemdir. Bu işlemde yemek borusu (özofagus), mide (gaster) ve ince bağırsağın ilk kısmı (duodenum) video endoskopla görüntülenerek tanı konur. Milimetrik doku biyopsileri alınıp mikroskop altında incelenerek ayrıntılı tanı konmasına olanak sağlar. Endoskopik işlemlerle kanamalar durdurulur (yapıştırıcı enjeksiyonu, bant ligasyonu vs.). Polipler çıkartılır. Yanlışlıkla ya da farklı nedenlerle yutulan yabancı cisimler yemek borusu, mide ve ince bağırsak üst kısmında ise endoskopla çıkartılır. Ayrıca PEG (perkütan endoskopik gastrostomi), PEJ, DPEJ denilen sindirim kanalının karın cildine ağızlaştırılması ile yapılan beslenme tüpleri endoskop yardımıyla yerleştirilir. Daralmış yemek borusunun genişletilmesi ve bazı reflü operasyonları da endoskopik olarak yapılmaktadır.
?Çocukluk çağı sağlığının izlemi ve hastalıkları ayrı bir uzmanlık gerektirmesinin yanı sıra çocukluk çağının gastrointestinal sistem hastalıklarına yaklaşım da erişkin dönem hastalıklarından çok farklıdır. Bu nedenle çocuklarda (0-18 yaş) endoskopik işlemler ‘Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Uzmanlığı’nı tamamlamış uzman doktorlardan ‘Çocuk Gastroenteroloji, Hepatoloji ve Beslenme Uzmanı’ yan dal uzmanlığı tamamlamış uzman hekimler tarafından yapılır.
‘Çocuk Gastroenteroloji, hepatoloji ve beslenme uzmanı’ tarafından genellikle anestezi uzmanı ile birlikte sedasyon anestezisi altında yapılır. Ağız yoluyla videoendoskopla sırasıyla yemek borusu, mide ve duodenum denilen ince bağırsağın ilk iki kısmına ilerlenir. İşlem süresi genellikle 10-30 dakikadır. İşlem sonrası iki saat içinde sıvı beslenme başlanır. Çocuğun hastanede yatırılmasına gerek yoktur. İşlem öncesi aç kalma süresi çocuğun yaşına göre değişiklik göstermektedir.